De werking van CJT vertrekt vanuit een aantal waarden:

Jeugdverblijfcentra staan open voor iedereen, ongeacht etnische afkomst, geloof, geslacht, seksuele geaardheid e.d.  
     
Kinderen en jongeren moeten kunnen verblijven in veilige omstandigheden.  
     
De uitbating van een jeugdverblijfcentrum gebeurt met respect voor het milieu en de toekomstige generaties.  
     
Jeugdverblijfcentra moeten uitnodigen tot een gezond verblijf, bijvoorbeeld door de mogelijkheid op beweging en gezonde maaltijden.  
     
In een jeugdverblijfcentrum moeten kinderen en jongeren de kans krijgen om te ontdekken en grenzen te verleggen.